中大新聞網(wǎng)訊（通訊員簡文楊、戴希安、禹匯川）近日，中山大學附屬第六醫(yī)院駱衍新、禹匯川團隊研發(fā)的表觀遺傳學技術CD8+ MeTIL在英國腫瘤免疫治療學會會刊Journal for ImmunoTherapy of Cancer（JITC，IF=13.7）發(fā)表。這項技術可以精確地定量評估腫瘤微環(huán)境中CD8+ T細胞的浸潤豐度，為腫瘤微環(huán)境的研究領域提供了一種重要的定量觀測工具，在腫瘤免疫治療中具有重要的臨床意義。
本研究由附屬第六醫(yī)院結(jié)直腸肛門外科和胃腸病學研究所團隊牽頭，美國華盛頓大學醫(yī)學中心、梅奧診所、加拿大多倫多大學和澳大利亞墨爾本大學協(xié)作完成。論文題為“DNA methylation-based signature of CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes enables evaluation of immune response and prognosis in colorectal cancer”（腫瘤浸潤CD8+淋巴細胞的DNA甲基化圖譜可用于評估結(jié)直腸癌的免疫反應和治療結(jié)局），附屬第六醫(yī)院禹匯川助理研究員和駱衍新主任醫(yī)師為論文通訊作者，鄒齊博士、王小琳助理研究員和任東林教授為論文第一作者。
結(jié)直腸癌是全球腫瘤相關死亡的主要原因之一，治療方法通常包括手術切除、放化療、靶向治療以及各種免疫療法。然而，對這些治療的反應在患者之間是不同的。例如，PD-1 等免疫檢查點抑制劑療法在腫瘤治療中取得了進展，但很多患者要么沒有反應，要么產(chǎn)生耐藥性。
腫瘤微環(huán)境中的CD8+ T細胞的數(shù)量和功能狀態(tài)對腫瘤的治療效果有巨大影響。了解腫瘤微環(huán)境中的CD8+ T 細胞數(shù)量可以預測治療中腫瘤的免疫應答，具有實際的臨床指導意義。
DNA甲基化為一種可遺傳的DNA化學修飾，能夠在不改變DNA序列的前提下，產(chǎn)生可遺傳性改變。DNA甲基化的動態(tài)改變在CD8+ T細胞的分化、成熟和活化中起著關鍵作用。同時，DNA甲基化具有組織特異性，在不同組織和器官的細胞中有所不同，并有可能成為識別不同細胞的標志物。
在這項研究中，團隊成員首先構(gòu)建了CD8+ T細胞特異的DNA甲基化圖譜，并在此基礎上構(gòu)建了CD8+ MeTIL細胞分類器。研究團隊在DNA甲基化的基礎和應用領域進行了多年研究，前期已經(jīng)開發(fā)了一項在單堿基分辨率下檢測基因組甲基化水平的分子檢測技術及其定量系統(tǒng)QASM（Clinical Chemistry 2019）。應用此項技術，通過三組反應即可快速實現(xiàn)CD8+ MeTIL的檢測和腫瘤免疫細胞浸潤的定量評估。技術流程易于標準化，經(jīng)濟、時間和人力成本低。多個臨床中心的腫瘤標本檢測結(jié)果顯示，CD8+ MeTIL能很好地預測腫瘤免疫檢查點阻斷劑治療和腫瘤生存結(jié)局，表現(xiàn)出了臨床轉(zhuǎn)化應用的潛力和前景。研究團隊基于這項研究申請了國家發(fā)明專利：用于評估組織免疫反應和診斷預后的DNA甲基化檢測試劑盒（202011176816.1）。
圖1 CD8+ T細胞特異的甲基化圖譜
圖2 QASM技術檢測CD8+ MeTIL原理和流程
CD8+ MeTIL作為一種數(shù)字細胞分類器，可以在表觀遺傳的水平準確地定量腫瘤微環(huán)境中的CD8+ T細胞。與其它組學數(shù)據(jù)聯(lián)合分析，將有助于理解表觀遺傳在CD8+ T細胞分化、活化和抗腫瘤免疫中的作用。CD8+ MeTIL作為生物標志物，能與免疫組化等技術互補，應用于臨床，為包括免疫治療在內(nèi)的多種治療方法的選擇提供有價值的信息。
